MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus gordonii str. Challis substr. CH1 chromosome

Total Repeats: 45023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009785	TA	3	6	27	32	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009785	AAT	2	6	162	167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149691
3	NC_009785	A	8	8	222	229	100 %	0 %	0 %	0 %	157149691
4	NC_009785	T	6	6	241	246	0 %	100 %	0 %	0 %	157149691
5	NC_009785	GATT	2	8	260	267	25 %	50 %	25 %	0 %	157149691
6	NC_009785	AAT	2	6	277	282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149691
7	NC_009785	AGA	2	6	411	416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149691
8	NC_009785	AGA	2	6	426	431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149691
9	NC_009785	ATTT	2	8	436	443	25 %	75 %	0 %	0 %	157149691
10	NC_009785	CAG	2	6	451	456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149691
11	NC_009785	GAAAA	2	10	469	478	80 %	0 %	20 %	0 %	157149691
12	NC_009785	A	6	6	475	480	100 %	0 %	0 %	0 %	157149691
13	NC_009785	TCC	2	6	483	488	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157149691
14	NC_009785	TGG	2	6	621	626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157149691
15	NC_009785	TTA	2	6	649	654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157149691
16	NC_009785	CTG	2	6	713	718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149691
17	NC_009785	TAT	2	6	800	805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157149691
18	NC_009785	GAT	2	6	811	816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149691
19	NC_009785	A	6	6	832	837	100 %	0 %	0 %	0 %	157149691
20	NC_009785	AAG	2	6	848	853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149691
21	NC_009785	T	6	6	856	861	0 %	100 %	0 %	0 %	157149691
22	NC_009785	ACT	2	6	926	931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149691
23	NC_009785	GAA	2	6	943	948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149691
24	NC_009785	CTC	2	6	992	997	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157149691
25	NC_009785	GAA	2	6	1039	1044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149691
26	NC_009785	ATA	2	6	1373	1378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149691
27	NC_009785	ACA	2	6	1420	1425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157149691
28	NC_009785	AGA	3	9	1461	1469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149691
29	NC_009785	A	6	6	1500	1505	100 %	0 %	0 %	0 %	157149691
30	NC_009785	TAAAA	2	10	1506	1515	80 %	20 %	0 %	0 %	157149691
31	NC_009785	T	6	6	1530	1535	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009785	CTA	2	6	1626	1631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_009785	TAA	2	6	1644	1649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009785	ATAA	2	8	1652	1659	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009785	TAA	2	6	1691	1696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157151517
36	NC_009785	ATTT	2	8	1699	1706	25 %	75 %	0 %	0 %	157151517
37	NC_009785	AAT	2	6	1854	1859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157151517
38	NC_009785	CTT	2	6	1899	1904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157151517
39	NC_009785	CTTT	2	8	1912	1919	0 %	75 %	0 %	25 %	157151517
40	NC_009785	TGT	2	6	1925	1930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157151517
41	NC_009785	AGCAAA	2	12	1972	1983	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	157151517
42	NC_009785	TAAT	2	8	2107	2114	50 %	50 %	0 %	0 %	157151517
43	NC_009785	GTC	2	6	2146	2151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157151517
44	NC_009785	ATT	2	6	2241	2246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157151517
45	NC_009785	A	7	7	2251	2257	100 %	0 %	0 %	0 %	157151517
46	NC_009785	GTT	2	6	2274	2279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157151517
47	NC_009785	ATC	2	6	2356	2361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157151517
48	NC_009785	GTT	2	6	2460	2465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157151517
49	NC_009785	TGC	2	6	2489	2494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157151517
50	NC_009785	TAT	2	6	2512	2517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157151517
51	NC_009785	CA	3	6	2525	2530	50 %	0 %	0 %	50 %	157151517
52	NC_009785	TGAA	2	8	2605	2612	50 %	25 %	25 %	0 %	157151517
53	NC_009785	GA	3	6	2638	2643	50 %	0 %	50 %	0 %	157151517
54	NC_009785	AAG	3	9	2764	2772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157151517
55	NC_009785	AATT	2	8	2782	2789	50 %	50 %	0 %	0 %	157151517
56	NC_009785	TGAAA	2	10	2833	2842	60 %	20 %	20 %	0 %	157151188
57	NC_009785	TGT	2	6	2947	2952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157151188
58	NC_009785	GAT	2	6	2953	2958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157151188
59	NC_009785	GA	3	6	2975	2980	50 %	0 %	50 %	0 %	157151188
60	NC_009785	A	6	6	2987	2992	100 %	0 %	0 %	0 %	157151188
61	NC_009785	TGA	2	6	3001	3006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157151188
62	NC_009785	TAT	2	6	3021	3026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157150252
63	NC_009785	T	7	7	3026	3032	0 %	100 %	0 %	0 %	157150252
64	NC_009785	TTC	2	6	3035	3040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157150252
65	NC_009785	T	6	6	3059	3064	0 %	100 %	0 %	0 %	157150252
66	NC_009785	T	6	6	3073	3078	0 %	100 %	0 %	0 %	157150252
67	NC_009785	T	7	7	3109	3115	0 %	100 %	0 %	0 %	157150252
68	NC_009785	T	7	7	3120	3126	0 %	100 %	0 %	0 %	157150252
69	NC_009785	ATC	2	6	3135	3140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157150252
70	NC_009785	TTC	2	6	3272	3277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157150252
71	NC_009785	AGC	2	6	3290	3295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157150252
72	NC_009785	T	7	7	3297	3303	0 %	100 %	0 %	0 %	157150252
73	NC_009785	CTT	2	6	3307	3312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157150252
74	NC_009785	TCA	2	6	3318	3323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157150252
75	NC_009785	GAAAT	2	10	3342	3351	60 %	20 %	20 %	0 %	157150252
76	NC_009785	AGT	2	6	3356	3361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157150252
77	NC_009785	TAG	2	6	3390	3395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157150252
78	NC_009785	TTGAT	2	10	3413	3422	20 %	60 %	20 %	0 %	157150252
79	NC_009785	TAA	2	6	3438	3443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157150252
80	NC_009785	CTT	3	9	3448	3456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157150252
81	NC_009785	CTA	2	6	3469	3474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157150252
82	NC_009785	TAA	2	6	3518	3523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157150252
83	NC_009785	T	8	8	3528	3535	0 %	100 %	0 %	0 %	157150252
84	NC_009785	CAT	2	6	3536	3541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157150252
85	NC_009785	CCT	2	6	3547	3552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_009785	AAAT	2	8	3571	3578	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009785	T	7	7	3597	3603	0 %	100 %	0 %	0 %	157150786
88	NC_009785	T	8	8	3613	3620	0 %	100 %	0 %	0 %	157150786
89	NC_009785	CCTT	2	8	3670	3677	0 %	50 %	0 %	50 %	157150786
90	NC_009785	T	7	7	3720	3726	0 %	100 %	0 %	0 %	157150786
91	NC_009785	AAG	2	6	3820	3825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157150786
92	NC_009785	AG	4	8	3824	3831	50 %	0 %	50 %	0 %	157150786
93	NC_009785	T	6	6	3871	3876	0 %	100 %	0 %	0 %	157150786
94	NC_009785	GTA	2	6	3877	3882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157150786
95	NC_009785	GAAT	2	8	3898	3905	50 %	25 %	25 %	0 %	157150786
96	NC_009785	CTT	2	6	3917	3922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157150786
97	NC_009785	TGAT	2	8	3928	3935	25 %	50 %	25 %	0 %	157150786
98	NC_009785	TGTT	2	8	4008	4015	0 %	75 %	25 %	0 %	157150786
99	NC_009785	A	6	6	4038	4043	100 %	0 %	0 %	0 %	157150786
100	NC_009785	ATT	2	6	4053	4058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157150786
101	NC_009785	TGT	2	6	4059	4064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157150786
102	NC_009785	GTTTC	2	10	4075	4084	0 %	60 %	20 %	20 %	157150786
103	NC_009785	CAA	2	6	4097	4102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157150786
104	NC_009785	ATC	2	6	4110	4115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157150786
105	NC_009785	ATT	2	6	4203	4208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157150786
106	NC_009785	ATT	2	6	4239	4244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157150786
107	NC_009785	AAT	2	6	4248	4253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157150786
108	NC_009785	T	6	6	4277	4282	0 %	100 %	0 %	0 %	157150786
109	NC_009785	TTTG	2	8	4324	4331	0 %	75 %	25 %	0 %	157150786
110	NC_009785	ATT	2	6	4347	4352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157150786
111	NC_009785	TTA	2	6	4375	4380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157150786
112	NC_009785	A	6	6	4384	4389	100 %	0 %	0 %	0 %	157150786
113	NC_009785	TTTTG	2	10	4406	4415	0 %	80 %	20 %	0 %	157150786
114	NC_009785	AGATTA	2	12	4540	4551	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	157150786
115	NC_009785	AGA	2	6	4611	4616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157150786
116	NC_009785	A	6	6	4689	4694	100 %	0 %	0 %	0 %	157150786
117	NC_009785	TAT	3	9	4700	4708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157150786
118	NC_009785	GAA	2	6	4759	4764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157150786
119	NC_009785	CAAA	2	8	4834	4841	75 %	0 %	0 %	25 %	157150786
120	NC_009785	TGT	2	6	4848	4853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157150786
121	NC_009785	TAA	2	6	4905	4910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157150786
122	NC_009785	A	6	6	4957	4962	100 %	0 %	0 %	0 %	157150786
123	NC_009785	AAAAAC	2	12	4977	4988	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	157150786
124	NC_009785	AAAT	2	8	4991	4998	75 %	25 %	0 %	0 %	157150786
125	NC_009785	AATTT	2	10	5038	5047	40 %	60 %	0 %	0 %	157150786
126	NC_009785	CTG	2	6	5069	5074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157150786
127	NC_009785	AG	3	6	5092	5097	50 %	0 %	50 %	0 %	157150786
128	NC_009785	AATA	2	8	5184	5191	75 %	25 %	0 %	0 %	157150786
129	NC_009785	A	7	7	5202	5208	100 %	0 %	0 %	0 %	157150786
130	NC_009785	A	6	6	5247	5252	100 %	0 %	0 %	0 %	157150786
131	NC_009785	TAGC	2	8	5258	5265	25 %	25 %	25 %	25 %	157150786
132	NC_009785	T	6	6	5366	5371	0 %	100 %	0 %	0 %	157150786
133	NC_009785	ATA	2	6	5465	5470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157150786
134	NC_009785	A	6	6	5491	5496	100 %	0 %	0 %	0 %	157150786
135	NC_009785	TGT	2	6	5523	5528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157150786
136	NC_009785	A	6	6	5535	5540	100 %	0 %	0 %	0 %	157150786
137	NC_009785	A	6	6	5543	5548	100 %	0 %	0 %	0 %	157150786
138	NC_009785	CAT	2	6	5562	5567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157150786
139	NC_009785	AT	3	6	5566	5571	50 %	50 %	0 %	0 %	157150786
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